Главным музеем города по праву считается Ярославский историко-архитектурный музей-заповедник. Он расположен на территории бывшего Спасо-Преображенского монастыря.
Датой основания музея считается 12 января 1865 года, когда был открыт Музей при Обществе для естественно-исторического исследования Ярославской губернии.
