Порты острова делятся на замерзающие (Шахтёрск, Москальво, Поронайск и Алексанровск-Сахалинский) и незамерзающие (Невельск, Холмск). А в портах Корсаков и Пригородное в период льдообразования осуществляется ледокольная проводка судов. Специализация порта зависит от его географического положения: так, Пригородное служит для перегрузки углеводородов, так как расположен вблизи их месторождений, а через Корсаков и Холмск (юг и юго-запад) осуществляется материально-техническое снабжение области.
