Заповедник находится на территории Республики Хакасия и включает в себя девять изолированных участков в Орджоникидзевском, Ширинском, Боградском, Усть-Абаканском и Таштыпском районах. Он был образован в 1999 году на базе государственных природных заповедников «Чазы» и «Малый Абакан».
Цель заповедника – сохранение и изучение естественного хода природных процессов и явлений, сохранение генетического фонда растительного и животного мира, а также отдельных видов и сообществ растений и животных
Заповедник состоит из девяти кластеров общей площадью 267 565,3 гектаров:
«Подзаплоты»
«Озеро Белё»
«Озеро Шира»
«Озеро Иткуль»
«Оглахты»
«Камызякская степь с озером Улуг-коль»
«Хол-Богаз»
«Малый Абакан»
«Заимка Лыковых»
Несколько участков заповедника открыты для посещения туристами. Однако для этого требуется получить пропуск в Дирекции.
Для туристов открыты визит-центры на участках «Оглахты», «Озеро Иткуль» и «Озеро Беле», а также визит-центр в городе Абаза, многофункциональный центр в заказнике «Позарым»и музей природыв городе Абакан
