Основан в 1989 году. Основатель музея – Виктор Валентинович Рудольф – энтузиаст, знаток истории и этнографии края. Собранная им этнографическая коллекция стала основой музейного собрания.
Наиболее ценные коллекции в настоящее время – Мангазейская археологическая коллекция; коллекция предметов материальной и духовной культуры тазовских селькупов (северная группа); коллекция рукописных и старопечатных книг; фотоколлекция.
Одна из главных достопримечательностей музея – экспозиция под открытым небом «Селькупский дом» (пл. 500 м2), где представлены деревянные дома и строения, сохранившиеся в традиционной культуре селькупов, коренных жителей бассейна реки Таз.