В собрании музея более ста тысяч единиц хранения: пластика пермского звериного стиля VIII—III века до н. э., образцы «Сасанидского серебра» — иранские блюда, найденные недалеко от Чердыни, восточное серебро VII—X веков, пермская деревянная скульптура «шакшерской школы», коллекция иконописи, нумизматики, этнографии, собрание старопечатной и рукописной книги XVI—XX веков, образцы «крюкового» нотного письма. Музей хранит исторические реликвии национального значения, наиболее известные – оковы боярина М. Н. Романова, дяди первого царя из династии Романовых, и воинские доспехи X—XV веков. В 2000 году в здании бывшей церкви Успения Пресвятой Богородицы открылся второй филиал — музей истории веры.
