Название мечети переводится как «прощение». Мечеть построена в 1994 году на территории мусульманского кладбища, которое появилось в 1890-х годах.
С 2008 года имам-хатыбом мечети «Гуфран» служит Нух-хазрат Хасанов.
Раньше на этом месте находилась деревянная мечеть, построенная в 1909 году. Она называлась Пятой соборной мечетью. В 1960 году она была полностью уничтожена пожаром.