Ботанический сад является одной из самых уникальных достопримечательностей Соловецких островов, он находится в холмистой местности, между озёрами Нижний Перт и Пустынное. Площадь, занимаемая садом, составляет 5 гектаров. На территории сада сохранились и поддерживаются посадки как монастырского, так и лагерного времени. Здесь можно увидеть поклонный крест и две часовни XIX века, историческую резиденцию соловецкого архимандрита.
В саду всегда чуть теплее, чем в других частях Соловецкого архипелага