Музей был открыт 16 июня 1974 года. Основатель и первый директор музея — кандидат исторических наук, доктор философских наук, профессор, заслуженный работник культуры России Уткин Ксенофонт Дмитриевич-Нүһүлгэн.
Основная тематика музея — раскрытие взаимовлияния материальных и духовных культур русского и якутского народов. В этом контексте показана роль русских крестьян сел Антоновка, Александровка, Аммосовка как зачинателей земледелия в улусе. Большое место в музейной экспозиции уделено геологам Амакинской геологоразведочной экспедиции и изыскательским работам на Накынском месторождении алмазов. Фонд: насчитывает более 7 тысяч экспонатов.
17 ноября 1990 года при музее открыта Картинная галерея. В галерее представлены работы известных якутских графиков, скульпторов, живописцев. В 1978 году музей преобразован в Нюрбинский государственный музей Дружбы народов и начал действовать как филиал Якутского государственного объединенного музея истории и культуры народов Севера им. Ем. Ярославского. Ныне музей не является филиалом республиканского музея. Музей оформлен как юридическое лицо, имеет устав, печать, счет.
Филиал музея — музей «Дьөһөгөй ођото» Мегежекского наслега села Хаты Нюрбинского района.
