Основан в 30-е годы XX века решением Наркомпроса РСФСР, как музей Подмосковного угольного бассейна. Основателем и первым директором музея был Владимир Николаевич Хмелёв. В 1935 году был открыт для посещений. В 1940 году появился второй в Советском союзе планетарий. Уникальный аппарат был сконструирован научным сотрудником музея, изобретателем-самоучкой Чистозвоновым М. В.
Планетарий работал до 1991 года, пока музей располагался в здании бывшей церкви. В феврале 1996 года музей Подмосковного угольного бассейна и планетарий переехали в Историко-мемориальный музейный комплекс «Бобрики».
Музейный комплекс расположен в исторической части города на Бобрик-Горе, в том самом месте, где во времена Петра Первого располагалось несколько шлюзов канала, по которым Пётр хотел соединить Дон и Волгу посредством рек Шат и Упа (наш самый первый Волгодонский канал) и где в 1773 году императрица Екатерина Вторая основала усадьбу Бобрики, в последствии переданную во владение незаконнорожденному сыну императрицы Бобринскому Алексею Григорьевичу.
14 июля 1940 года в музее был открыт второй, после Московского, в Советском Союзе планетарий. Изобрел его научный сотрудник музея Михаил Васильевич Чистозвонов. Это был первый советский аппарат, а в мире тогда насчитывалось всего 23 планетария.