14 мая 1991 года во время пребывания в Северске Патриарх всея Руси Алексий II освятил камень, символизирующий возведение на этом месте будущего храма Владимирской иконы Божией Матери. Строительство храма началось 8 августа 1994 года по проекту северского архитектора А.Ершова. В архитектурном плане храм построен в старорусских традициях. Внутри есть молитвенное помещение на 400 человек, крестильная комната на 30 человек, библиотека, гардероб, служебные помещения. 22 мая 1998 года состоялось освящение и установка крестов и куполов храма.
Освящение совершал по благословлению епископа святого Аркадия иерей Михаил. Золочение крестов и куполов производили умельцы из города Трехгорного. Строило северский храм СП ОАО «Химстрой». 7 января 2000 года в светлый для всех православных день Рождества Христова в храме Владимирской иконы Божией Матери состоялась первая служба. В 2003 году во время второго визита в Томск и Северск Патриарха всея Руси Алексия II построенный храм был освящен.
