Здание было построено в 1852-1854 гг. В конце XIX века Томск был центральной станицей Сибирского тракта и местом складирования и перевалки сибирского транзита. Китайский чай, сибирское сырье и многие другие товары направлялись в Томск для дальнейшего следования. Поэтому Биржевый корпус предназначался для складирования товаров, розничной торговли и одновременно был местом собраний купеческого общества.
В 1933 году здесь функционировал Томский хлебозавод №1, в 1972 — лаборатории Института оптики атмосферы СО АН СССР. Кроме того, в 70-е гг. в здании располагался выставочный зал Томского отделения художественного фонда РСФСР. В 1987 году в здании Биржевого корпуса открылся один из филиалов Томской областной библиотеки имени А. С. Пушкина. В настоящее время в Биржевом корпусе располагается Западносибирский филиал Академии правосудия.