Часовня была построена в 1992 году на месте разрушенного монастыря XV века.
В этом монастыре в 1460-х годах был написан важный труд – Житие Саввы Вишерского, именно здесь принял постриг св. Палладий Роговский – первый российский доктор философии и богословия, поучивший образование в Западной Европе. Позже, монастырь был закрыт Екатериной II, но спасен иеромонахом Варлаамом и монахом Иосаафом, в миру известными как отставной поручик Измайловского полка Василий Глазатов и дворянин Иван Аничков.
Закрыли монастырь в 1930-х годах. Во время Великой отечественной войны монастырские постройки сильно пострадали. Позже, здесь находились склады и мастерские.
В 1975 году, во после время съемок фильма «Дожить до рассвета», от некогда величественных зданий остались только руины.
В 1991 году, в деревне Савино началось строительство церкви, чуть позже археолог Трояновский в ходе раскопок обнаружил мощи прп. Саввы, а на месте руин появилась часовня.
