Покровским монастырь назван по главному храму Покрова Богородицы, Звериным – по месту существовавшего здесь в XI веке зверинца, то есть, заповедных угодий для проведения княжеской охоты.
Впервые монастырь упоминается в летописи под 1148 годом.
Самый древний храм на его территории – Покровская церковь, возведенная в камне в 1399 году. Позднее она неоднократно перестраивалась и поновлялась. В 1899-1901 годах на месте западного придела был возведен большой пятиглавый каменный Покровский собор (ныне действующий). Святыня собора — рака с мощами Преподобного Саввы Вишерского.
Весь монастырский комплекс с 1992 года – объект Всемирного культурного наследия ЮНЕСКО.