Музей «Археология, этнография и экология Сибири» основан в 1976 году при Кемеровском государственном университете. Музей КемГУ – крупнейший вузовский музей региона. Он возглавляет научно-методический совет вузовских музеев Кузбасса, входит в Ассоциацию естественно-исторических музеев России, Совет исторических и краеведческих музеев Сибири, Межрегиональную сибирскую ассоциацию исследователей первобытного искусства.
Музей включает в себя экспозиционные залы, библиотеку, фототеку, архив, реставрационную и таксидермическую мастерские, камеральную лабораторию, фондохранилища, учебные аудитории.
Экспозиция музея состоит из трех отделов: археологии, этнографии, природы и экологии. Отдел археологии включает предметный комплекс от эпохи позднего палеолита до Средневековья. Отдел этнографии знакомит с материальной и духовной культурой шорцев, телеутов, хакасов и русских Сибири конца XIX — начала XX в. Отдел экологии расскажет о представителях фауны природных зон Кузнецкой котловины и сопредельных территорий.
Также при музее с 2003 года работает отдел истории Кемеровского университета.
Экспозиции размещаются в главном корпусе КемГУ.