Калининградский автовокзал был открыт в 1971 году на базе Автоколонны № 1115. В 1976 году было создано производственное объединение автовокзалов и пассажирских станций, которое к середине 80-х гг. состояло из двух вокзалов и восемнадцати автостанций с общим пассажирооборотом около 6,5 миллионов в год.
В настоящее время в состав производственно-хозяйственного комплекса входят автовокзалы Калининграда и Советска, а также десять автостанций городов Большаково, Гвардейск, Гусев, Железнодорожный, Краснознаменск, Неман, Озёрск, Правдинск, Славск и Черняховск.
Маршрутная сеть автовокзала постоянно расширяется и совершенствуется. Новые маршруты охватывают удалённые от областного центра населённые пункты.
Пассажирооборот калининградского автовокзала в 2014 году составил 3,4 миллиона человек.
На территории автовокзала расположены кассы международных автобусных линий «Ecolines». Автобусы «Ecolines» выполняют еженедельные рейсы по направлениям Беларусь, Германия, Дания, Латвия, Литва, Нидерланды, Польша, Чехия и Эстония.
