Основан 7 ноября 1924 года как Грозненский окружной музей истории и религии.
Незадолго до войны в 1994 году музей размещался в здании, являющимся историко-архитектурным памятником рубежа ХIХ — начала ХХ века, бывшем Азово-Донском банке. В период нейтрализации в Чечне незаконных вооруженных формирований 1994-1996 годов здание было практически разрушено, а сам музей потерял свою материально-техническую базу (до 90% своих фондов).
5 октября 2012 года в Грозном состоялось торжественное открытие нового здания Национального музея Чеченской Республики. Сегодня Национальный музей уже проводит выставки своих экспозиций и активно работает над пополнением экспонатного фонда.
Среди предметов археологической коллекции музея выделяются экспонаты раскопок Сержень-Юртовского поселения и могильника – выдающегося памятника знаменитой кобанской культуры Кавказа. В числе экспонируемых музейных предметов – украшения из бронзы и боевые доспехи чеченского воина конца эпохи позднего средневековья из селения Тусхарой Итум-Калинского района Чеченской Республики. В центральном экспозиционно-выставочном зале представлены предметы самобытной материальной культуры чеченцев, отражающие традиционный быт, хозяйственную деятельность, искусство Чечни.