В середине XIX века, с согласия коренного населения здесь поселились 30 крестьянских семей из Смоленской волости Бийского уезда. Основано в 1842 году. В 1849 году образован миссионерский стан, который с того времени контролировал развитие Чемала. В конце XIX века село стало известно как бальнеологический курорт.
В советское время, в 1930-х годах был основан курорт для руководителей партии и государства, а также их семей. При участии жены М. И. Калинина Екатерины Ивановны, которая жила здесь в 1931—1935 годах, создан противотуберкулёзный санаторий, совхоз, хлебопекарня, банно-прачечный комбинат.